Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms