Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pax8Q00288 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms