Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme1P97371 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme1P97371 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms