Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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