Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms