Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Rps28P62858 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rps28P62858 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms