Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms