Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah1aP61092 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms