Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms