Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms