Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gsc2P56916 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsc2P56916 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms