Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf5P56477 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms