Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NcanP55066 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcanP55066 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NcanP55066 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NcanP55066 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NcanP55066 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NcanP55066 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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