Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lbx1P52955 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms