Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa9P50707 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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