Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp3P49194 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms