Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3aP47708 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3aP47708 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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