Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc2P43407 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms