Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf5P43027 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf5P43027 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gdf5P43027 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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