Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rfc1P35601 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfc1P35601 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfc1P35601 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfc1P35601 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc1P35601 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc1P35601 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc1P35601 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc1P35601 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc1P35601 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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