Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp4P35123 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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