Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rom1P32958 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rom1P32958 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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