Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprmP28828 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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