Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxrgP28705 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxrgP28705 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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