Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms