Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde6aP27664 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms