Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PdgfraP26618 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms