Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NdnP25233 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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NdnP25233 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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NdnP25233 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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NdnP25233 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NdnP25233 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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NdnP25233 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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NdnP25233 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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NdnP25233 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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NdnP25233 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NdnP25233 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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