Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd5P13379 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms