Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PolP10400 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PolP10400 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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