Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calm3P0DP28 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calm3P0DP28 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms