Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprqP0C5E4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprqP0C5E4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprqP0C5E4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprqP0C5E4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprqP0C5E4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprqP0C5E4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprqP0C5E4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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