Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LtaP09225 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LtaP09225 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LtaP09225 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LtaP09225 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LtaP09225 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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