Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp1O89090 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Sp1O89090 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp1O89090 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Sp1O89090 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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