Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cops6O88545 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cops6O88545 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cops6O88545 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Cops6O88545 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Cops6O88545 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Cops6O88545 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Cops6O88545 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Cops6O88545 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cops6O88545 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms