Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ldb2O55203 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ldb2O55203 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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