Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syngr1O55100 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syngr1O55100 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syngr1O55100 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syngr1O55100 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syngr1O55100 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syngr1O55100 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syngr1O55100 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms