Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SlkO54988 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SlkO54988 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SlkO54988 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SlkO54988 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SlkO54988 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms