Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TsksO54887 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TsksO54887 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TsksO54887 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TsksO54887 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms