Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnnd2O35927 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnnd2O35927 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms