Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cited2O35740 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cited2O35740 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms