Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Opn1mwO35599 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn1mwO35599 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms