Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ebi3O35228 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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