Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Efna3O08545 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms