Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm6871L7N248 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm6871L7N248 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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