Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Gm20939L7N243 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20939L7N243 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20939L7N243 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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