Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm19965J3QNY8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms