Protein–RNA interactions for Protein: J3QN05

Gm21834, Predicted gene, 21834, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21834J3QN05 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21834J3QN05 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms