Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Top6blJ3QMY9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Top6blJ3QMY9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top6blJ3QMY9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Top6blJ3QMY9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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