Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp17lcG5E8I7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp17lcG5E8I7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp17lcG5E8I7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17lcG5E8I7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp17lcG5E8I7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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